提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
三明治连锁餐厅赛百味被曝寻求出售,估值或超100亿美元******
三明治连锁餐厅巨头赛百味据称寻求出售。
美国东部时间1月11日,据多家美国媒体报道,三明治连锁餐厅赛百味(Subway)寻求出售,估值或超100亿美元。
据路透社和华尔街日报报道,知情人士透露,赛百味正寻求出售其业务。据华尔街日报报道所述,有知情人士称赛百味已聘请顾问寻求出售这家封闭型控股公司(注:股东人数有限,不公开招股)。
华尔街日报援引知情人士的说法称,该事项尚处于初期阶段,预计将吸引潜在企业买家和私募股权公司,赛百味的估值或将超过100亿美元。但赛百味仍有可能选择不出售或是其他交易。
“作为一家私营企业,我们不对所有权结构和商业计划发表评论,”赛百味回应外媒时表示。“我们继续专注于通过我们的转型推动品牌发展,来帮助我们的加盟商取得成功、实现盈利。”
总部位于美国的赛百味,是世界上最大的连锁餐厅之一,以制作12英寸(30cm)和6英寸(15cm)的三明治而闻名。据赛百味官网所述,其创立于1965年,由两个创始人家族持有,从1974年开始采用特许经营的商业模式。截至2021年,该公司在全球市场拥有约3.7万家门店。
据华尔街日报报道,行业研究公司Technomic的数据显示,2021年,赛百味在美国的约2.1万家门店从疫情中恢复过来,创造了94亿美元的销售额,较上年同期增长了13%。
华尔街日报报道称,在过去的十年里,赛百味走得跌跌撞撞。Technomic数据显示,赛百味的全球销售额在2012年达到顶峰,约180亿美元,此后数年均下滑。赛百味面临商店关门、加盟商退出的困境,而新的三明治店竞争对手也在不断涌现。
实际上,2021年就有报道称赛百味正在整理业务并寻求出售,但彼时这家连锁餐厅否认了该消息。
2015年,赛百味成立50周年之际,联合创始人Fred DeLuca去世,其妹妹Suzanne Greco接管公司,于2018年退休。另一位联合创始人与初始投资者Peter Buck于2021年去世。
2019年,这家连锁餐厅聘任了第一位首席执行官John Chidsey。据华尔街日报报道,Chidsey自掌舵以来,一直致力于扭转赛百味的局面。他关闭分店,重组公司的运营,并聚焦改善赛百味的菜单和餐品质量。Chidsey曾表示,他预计赛百味的美国业务将趋于平稳,并将向海外扩张更多业务。
赛百味官网2022年10月12日披露,其第三季度的同店销售额同比(较上年同期)增长了 8.4%。彼时,赛百味的北美区总裁Trevor Haynes表示,赛百味系列的表现以及来自顾客和加盟商的积极反馈,证明了这家连锁餐厅的改革策略正在起作用。
(文图:赵筱尘 巫邓炎)